آیت الله سید احمد خاتمی امام جمعه موقت تهران گفت: منافقین در سال ۵۴ مارکسیسم را مکتب زندگی معرفی و اعلام ارتداد کردند لذا شهید رجایی در فتنه منافقین گرفتار نشد و از سران این جریان، به شدت اعلام تنفر و به صراحت اعلام برائت کرد که نشان دهنده عمق بصیرت او بود.